十二歲的米高住在墨西哥聖塞西莉亞一個小村莊，村裡洋溢著慶祝亡靈節的氣氛。米高的高祖父為了實現音樂夢想，離鄉背井、拋妻棄女，於是高祖母伊美黛就禁止李維拉一家（Riveras）後代接觸音樂而從事製鞋家業[註 2]。然而，米高從小就夢想成為一名音樂家，就像他的偶像德拉古司一樣。德拉古司是以《請記住我》（毋忘我）一曲成名的流行歌手和電影明星[註 3]，不幸在1942年的演唱會現場發生意外被鐘砸死。在親戚裡面，只有米高的曾祖母可可不反對音樂，所以米高很喜歡她。米高無意發現亡靈節供桌上一張破損的相片有曾祖母、高祖父母的合影，但是高祖父的臉被撕掉了。不過他察覺高祖父所持有的吉他是音樂家德拉古司的，便深信高祖父就是吉他之神德拉古司。大喜過望的米高拿著吉他告訴家人要參加選秀比賽，奶奶得知大發雷霆，將吉他奪過來摔爛，米高傷心奪門而出。
米高把腦筋動到德拉古司的吉他上，偷偷潛入他的陵墓。拿起吉他輕彈了一下，突然就在現實世界消失、人們都看不到他，除了米高的朋友，一隻流落街頭的墨西哥無毛犬叫做丹丹（Dante）[註 4]。在墓地裡，米高遇到他死去的親人都變成骷髏，他們很驚訝的看著米高，覺得米高的出現和伊美黛不能去現實世界有關，所以他把米高帶到「夜總會」（Land of the Dead），一個死去的人生活的地方。只有在亡靈節的時候，已故的親人才能去現實世界和生者團聚。
在夜總會，伊美黛、米高和他的親人發現伊美黛不能去現實世界，是因為在亡靈節供奉的相片中伊美黛的肖像被米高從祭壇上取走，帶在身上。米高必須在日出前離開，否則他會變成骷髏永遠待在那裡。回到現實世界的方法是，只要他有一片帶著親人祝福的萬壽菊花瓣[註 5]；伊美黛同意讓米高回家，條件是米高放棄自己的音樂夢想。米高回到陵墓不放棄依舊拿著吉他要去參加比賽，結果又回到夜總會，表明拒絕放棄音樂夢想而逃離。隨後米高巧遇海特，一心想到現實世界中的人。米高聲稱德拉古司是他唯一的親人，海特同意幫助他找到德拉古司，米高就可以繼續堅持自己的夢想；交換條件是、米高同意把海特的相片放在他家供桌當中，這樣他就可以通過連接夜總會和現實世界中的橋。
接近德拉古司的方法是參加音樂比賽，獎品是德拉古司的宮殿入場券。海特要從他的朋友齊恰龍那裡借吉他，好讓米高參賽。不久看到齊恰龍消失，米高才知被現實世界中所有人遺忘的時候，亡靈就會真正的消失了。海特把米高的臉畫成了骷髏的形狀，這樣他就可以自由行走在城市而不被家人發現。他們贏得了音樂比賽。但同時伊美黛靠著她的靈獸南瓜籽（Pepita）也跟蹤著米高[註 6]。海特發現米高可以隨時回到現實世界，要米高回親戚那裡而發生爭論。為此，米高離開海特和丹丹，決心獨自潛入德拉古司的宮殿。
在宮殿裡，米高告訴德拉古司，他就是其玄孫。德拉古司歡迎米高的到來，要給他帶有祝福的萬壽菊花瓣時，海特也潛入宮殿，透露他曾是著名的歌手和作曲家，是德拉古司的搭檔。宮殿螢幕播放著似曾相識的片段讓海特回想起他死的那天，決定放棄音樂產業與家人在一起，但德拉古司卻憤而毒死他，並偷走海特的歌曲和吉他，藉此成名。德拉古司把海特的相片收進上衣口袋，把海特和米高推進一個巨大的洞穴湖中。
在洞穴裡，米高意識到家人的目的，並希望與他們和解；海特則道出他想過橋的主要原因是再次看到女兒可可，米高才知海特是他真正的高祖父。而唯一還記得海特的健在者可可的記憶力正在衰退，海特開始逐漸消失，太陽升起之後，就會永遠消失。在丹丹的幫助下，伊美黛駕著南瓜籽發現米高、和海特重逢；且丹丹因幫助米高他們脫困也變成靈獸。米高說服伊美黛和她的家人來幫助他從德拉古司身上搶到海特的相片。伊美黛陰錯陽差在德拉古司的舞台上演唱，可是計劃失敗了。現場轉播中憤怒的德拉古司把米高從高處丟下，企圖殺害米高毀滅證據(此場面也讓觀眾親眼目睹了德拉古司的惡劣本性)，所幸南瓜籽救回米高，不過海特的相片卻掉進洞穴湖裡。不知已被蘿西塔太婆與維多莉亞姨婆合力將自身惡行公諸於世的德拉古司重返舞台時被粉絲唾棄，南瓜籽發威將德拉古司踹去撞宮殿大鐘，如生前般，大鐘再次砸在他身上，現場歡聲雷動。
太陽緩緩升起，海特開始慢慢消失。米高向海特承諾要讓可可永遠都不會忘記他。然後伊美黛送米高回聖塞西莉亞。回到現實世界後，米高拿起原屬海特的吉他跑回家，試圖讓遲鈍的曾祖母可可回憶起海特。在最後絕望的嘗試中，米高含淚彈唱歌曲《請記住我》。這是海特曾深情獻給他的女兒可可的歌曲，觸發可可的記憶而跟著唱起來，從抽屜取出相關記事，內有合照中海特缺失的臉那一角，她和米高分享她對爸爸海特的一些回憶，一家大團圓和解。
一年之後的亡靈節，米高向家族新成員小妹介紹先人，當中也有已故的曾祖母可可。由於可可保存家書有德拉古司偷走海特作品的證據，德拉古司受世人鄙棄，海特獲得平反。在夜總會，海特和她的女兒可可一家過菊瓣橋和親人團聚，米高為在世及已逝親人彈唱，丹丹和貓咪型態的南瓜籽都是米高家庭的一分子，故事完美結束。
